Beşiktaş, Braga'yı elemesi halinde üçüncü turda, Lazio (İtalya)-Atletico Madrid (İspanya) eşleşmesinin galibiyle karşılaşacak.
Trabzonspor ise PSV'yi elemesi durumunda üçüncü turda Stoke City (İngiltere)-Valencia (İspanya) eşleşmesinin galibiyle mücadele edecek.
Üçüncü turda ilk maçlar 8 Mart 2012, rövanşları ise 15 Mart 2012'de oynanacak. UEFA Avrupa Ligi'nin finali ise Bükreş'teki Ulusal Stat'ta, 9 Mayıs 2012'de yapılacak.
Ligdeki ikinci ve üçüncü tur eşleşmeleri ise şöyle oldu:
-İkinci Tur-
------------
(1) Porto (Portekiz) - Manchester City (İngiltere)
(2) Ajax (Hollanda) - Manchester United (İngiltere)
(3) Lokomotiv Moskova (Rusya) - Athletic Bilbao (İspanya)
(4) Salzburg (Avusturya) - Metalist Kharkiv (Ukrayna)
(5) Stoke City (İngiltere) - Valencia (İspanya)
(6) Rubin Kazan (Rusya) - Olimpiakos (Yunanistan)
(7) AZ Alkmaar (Hollanda) - Anderlecht (Belçika)
(8) Lazio (İtalya) - Atletico Madrid (İspanya)
(9) Steau Bükreş (Romanya) - Twente (Hollanda)
(10) Viktoria Plzen (Çek C.) - Schalke 04 (Almanya)
(11) Wisla Krakow (Polonya) - Standard Liege (Belçika)
(12) Braga (Portekiz) - Beşiktaş (TÜRKİYE)
(13) Udinese (İtalya) - PAOK (Yunanistan)
(14) Trabzonspor (TÜRKİYE) - PSV Eindhoven (Hollanda)
(15) Hannover 96 (Almanya) - Club Brugge (Belçika)
(16) Legia Varşova (Polonya) - Sporting Lizbon (Portekiz)
-Üçüncü Tur-
------------
4. eşleşmenin galibi ile 6. eşleşmenin galibi
16. eşleşmenin galibi ile 1. eşleşmenin galibi
11. eşleşmenin galibi ile 15. eşleşmenin galibi
5. eşleşmenin galibi ile 14. eşleşmenin galibi
7. eşleşmenin galibi ile 13. eşleşmenin galibi
8. eşleşmenin galibi ile 12. eşleşmenin galibi
2. eşleşmenin galibi ile 3. eşleşmenin galibi
9. eşleşmenin galibi ile 10. eşleşmenin galibi
